長崎ゾーン・地球ゾーン・宇宙ゾーン・おもしろ実験室のある展示室の他、プラネタリウムの投影や全天周映画の上映を行う直径23m・座席数280席のスペースシアター、直径9mの大きさをもつ第一天文台、第2天文台等の施設がある。多彩な科学実験教室が開催されている。