永仁2年（1294年）に創建された、京都最初の法華宗寺院。天正15年（1587年）に現在地に移転。安土・桃山文化を担った芸術家や西陣織りの織り元など、ものづくりの作家や商人に支持され、広く民衆の帰依する寺として現在に至る。毎年12日開催の手作り市・フリーマーケット「西陣楽市楽座桃山文化村」や10月〜4月にかけて咲き続ける「会式桜（おえしきざくさ）」、冬季の「妙蓮寺椿」、晩夏から秋季の「芙蓉」など、花の寺としても有名。