宮崎・鹿児島両県にまたがる霧島火山群からなる霧島地域、桜島・指宿・佐多岬からなる錦江湾地域及び佐多岬の南方約60kmの洋上に浮かぶ屋久島の屋久島地域に分けられる。霧島地域は火口を持つ20数座の火山が集まり、火口湖は10を数える。シイ・カシなどの自然林が残り、山頂付近はミヤマキリシマに覆われている。錦江湾地域では桜島が今も活発な火山活動を続け、桜島や佐多岬には海中公園地区が指定されている。屋久島地域は、九州最高峰の宮之浦岳（1935m）の他、縄文杉などの巨樹、ヤクシカ・ヤクザルなどの野生生物が観察でき、また地域の一部が世界自然遺産地域に登録されるなど、世界的にも優れた自然が残されている。