目に見えない小さな生き物である“原生生物”は、わずか1つの細胞でも人間と同じように呼吸をしたり子孫を増やして生きている。そんな“原生生物”を中心に、ミクロの世界の様々な生き物を紹介する世界初のミクロ生物の博物館である。「ふしぎなミクロ生物シアター」では、様々なミクロ生物たちの幻想的で躍動感あふれる姿や、ミクロ生物と自然環境や人とのかかわりについて、大型スクリーンや４面のディスプレイを用いた迫力の映像で紹介され、「ふしぎなネイチャーラボ」では、専門職員の指導のもと、自分で顕微鏡を操作して思う存分ミクロの世界を堪能できる。（※要予約）また、専門職員と連携研究機関のバックアップにより、簡単な生物実験からハイレベルな実験や研究まで行うことができる。（※要会員申込）