元天台宗の寺門派の単立寺院で、本尊は鎌倉時代の作と伝えられる木造立像の不動明王。「岩倉門跡」「岩倉御所」とも呼ばれる。狩野派の画家による襖絵や、「床紅葉」「床緑」と愛称のついた黒光りする床など多数の見所を抱える。また、奥書院と客殿との間にある池泉回遊式庭園は希少なモリアオガエルの生息地で、枯れ山水の雄大な石庭であるとともに、新緑や紅葉の美しさで有名。紅葉のシーズンには夜間ライトアップも行われる。

通常公開されていない「つるの間」が例年この時期だけ公開され、奥比叡の山並を望む石庭をゆっくり眺めることができます。また、展示コーナーでは源氏千年紀を記念して、実相院に遺された源氏物語に関する資料から、当時どのように門跡寺院に源氏物語が享受されたかを探ります。